Чаще всего на разрешение программно-компьютерной экспертизы ставятся следующие вопросы:
— какова общая характеристика представленного программного обеспечения, из каких компонент (программных средств) оно состоит?
— обладает ли программное средство признаками контрафактности?
— имеют ли два программных продукта единый источник происхождения (при установлении авторских прав на программный продукт)?
— имеются ли в теле программного продукта реквизиты его разработчика и (или) владельца, если имеются, то какие?
— какое общее функциональное предназначение имеет программное средство?
— какие требования предъявляет данное программное средство к аппаратным средствам компьютерной системы?
— какова совместимость конкретного программного средства с представленной аппаратно-программной системой?
— используется ли данное программное средство для решения определенной функциональной задачи?
— каково фактическое состояние программного средства, его работоспособность по реализации отдельных (конкретных) функций?
— имеет ли программное средство защитные возможности (программные, аппаратно-программные) от несанкционированного доступа и копирования?
— каким образом организованы защитные возможности программного средства?
— каков общий алгоритм данного программного средства? — имеются ли на носителях информации исходные тексты (коды) программы?
— какие действия позволяют совершать внесенные в программу изменения?
— какова хронология использования программного средства (начиная с ее инсталляции)?
— каковы последствия дальнейшей эксплуатации определенного программного средства?
Ярким примером проведения программно-компьютерной экспертизы является исследование программных продуктов на признаки контрафактности и установления единого источника происхождения программных продуктов. Эта задача решается в рамках определения авторства программного продукта.